6月2日,科技日报记者从我国科学院青岛生物动力与进程研究所(以下简称“中科院青岛动力所”)得悉,该所联合我国食品发酵工业研究院等,开发了根据拉曼组原理的益生菌单细胞质检技能SCIVVS,为快速、精确、全面、低本钱的益生菌产品质检供给了全新的解决方案。相关效果近来宣布于iMeta杂志。
长期以来,益生菌质检大多依赖于别离培育或元基因组测序,存在耗时长、本钱高、复合益生菌产品深度质检困难等瓶颈。针对这一瓶颈,中科院青岛动力所单细胞中心联合我国食品发酵工业研究院、青岛东海药业和青岛星赛生物等团队,根据拉曼组原理,开发了一种名为SCIVVS的单细胞精度益生菌质检技能。
针对益生菌产品,SCIVVS提取一切细胞进行重水饲喂和单细胞拉曼光谱的高通量收集。在每一张拉曼光谱上,运用其指纹区,根据与益生菌单细胞拉曼光谱参照数据库的比对,快速完结每个细胞的品种判定环节。经过构建21种法定可食用益生菌的规范菌株拉曼光谱数据库,SCIVVS可完结均匀高达93%的分辩精确度。一起,运用其重水运用峰(C-D峰),则可针对每个物种,量化每个细胞的活性、代谢生机等。然后可经过拉曼激活单细胞分选技能,快速取得方针品种或方针代谢生机的单细胞,然后对接下流单细胞全基因组测序或培育。
为了支撑SCIVVS,中科院青岛动力所和青岛星赛生物协作,成功研发单细胞拉曼光镊分选仪、高通量流式拉曼分选仪。运用单细胞拉曼光镊分选仪,研究人员直接从纯种或复合益生菌产品动身,在5个小时之内,完结了精确到每个物种的活细胞计数、生机定量和生机异质性丈量。一起,针对乳酸杆菌、双歧杆菌或链球菌等各种益生菌,均能产出高质量的单细胞基因组(掩盖度可高达99.4%),然后完结精准溯源。
比照现在的益生菌产品质检办法,SCIVVS具有快速、精确、全面、低本钱、易于自动化等优势,较传统办法快20倍以上,而本钱仅为传统办法的1/10,且能免培育、高精度、自动化、一站式地完结产品中每个物种的活细胞计数、生机定量、生机异质性丈量和溯源,有望构成新的技能规范。
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