一是棉花种子的准备首先选择饱满成熟的棉花种子。饱满成熟的棉花种子种皮结构致密而坚硬，外有蜡质可防御外界温、湿度的影响，种皮内含有约的鞣酸物质，具有一定的抗菌作用，贮藏性好，未成熟的棉花种子不耐贮藏。所以应选择霜前花的棉子做种用贮藏。其次是剔除破损粒、霉烂粒、病虫粒等不健康的棉花种子。严控棉花种子入库指标。棉花种子安全入库标准为：水分不超过

  二是仓库的准备首先应对仓库全方面检查，确定仓库门窗关闭是否灵活，隔热和密封效果是否完好，监控仓库温、湿度的仪表是否能正常工作等。其次是清仓和消毒。清仓和消毒是防止品种混杂和病虫孳生的基础。清仓不仅将仓内不同品种的棉花种子、杂质、垃圾等全部清除，还要清理仓具、输送管道以及铲除仓外的杂草等。空仓消毒可用敌百虫或敌敌畏等处理。

  湿度检查入冬以后，水分在11%以下，每隔5天至10天检查1次。12%以下则应每天检查。湿度检查应在仓内的不同方位、不一样的层次定时定点进行。

  通风必须根据仓库内外的温度和相对湿度而定。当外界温、湿度均低于仓内时，是通风的最佳时机，此时通风既可降温又可排湿；当仓外温度与仓内温度相同、而仓外湿度低于仓内或仓内外湿度基本相同，或仓外温度不高于仓内时，也可以通风，前者以散湿为主，后者以降温为主。

  定期检测棉花种子质量棉花种子贮藏期间要按时进行检查棉花种子质量，以便及时了解棉花种子的贮藏情况，检测通常包括棉花种子发芽率试验、水分测定、游离脂肪酸测定，如察觉缺陷应及时解决。

  防火棉子有短绒，本身含油量又高，遇到火种就会造成燃烧。所以要严禁火种接近棉花种子仓，仓库周围也不要堆放易燃品。

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